Das Hochland - Die Andenregion
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Im Allgemeinen gibt es in Ecuador zwei Jahreszeiten: Die Trockenzeit (Sommer) und die Regenzeit (Winter). Dies variiert jedoch stark von Region zu Region. So herrscht z.B. in der Sierra Trockenzeit von Juni bis September und Regenzeit von Oktober bis Mai, wobei es auch in der Regenzeit meistens nur für einige Stunden am Tag regnet und man häufig gerade am Vormittag sehr schönes und sonniges Wetter genießen kann. Die Temperaturen variieren je nach Höhe, so liegt zwar die Durchschnittstemperatur bei 15°C, jedoch kann es in der Nacht auf bis zu 6°C herunter gehen und am Tag bis zu 26°C warm werden. Diese Angaben gelten für eine Höhe von ca. 2.000 Metern. Höher gelegene Regionen mitten in den Anden können hiervon natürlich stark abweichen.
Die Küste
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Die jährliche Durchschnittstemperatur an der Küste beträgt 26°C. 
Im Norden herrscht ein feucht-tropisches Klima während es im Zentrum des Landes trockener ist und der Süden durch tropisches und sub-tropisches Klima bestimmt wird. Die Regenzeit und gleichzeitig heißeste Periode ist zwischen Dezember und Mai im Zentrum und an der südlichen Küste um Guayaquil.
Das Amazonasgebiet 
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Im Regenwald des Amazonasgebiets ist das Klima feucht-tropisch. Dort gibt es eine Durchschnittstemperatur von ebenfalls 26°C mit einer Luftfeuchtigkeit von bis zu 97% und zum Teil starken Niederschlägen. Die geringsten Niederschläge gibt es in der Zeit zwischen Juli und November. Abweichend hiervon erstreckt sich die "Trockenzeit" im Norden des Amazonastieflands  von Dezember bis März. 
Die Galápagos-Inseln 
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Auf den Galapagos-Inseln ist das Klima sehr abwechslungsreich, von Dezember bis Mai ist es heiß, sonnig und feucht mit Regentagen, aber angenehmen Temperaturen zwischen 21°C und 30°C und einem entsprechend warmen Meereswasser. Von Juni bis November ist die kältere und trockene Jahreszeit mit Temperaturen von 17°C bis 24°C und kälteren Wassertemperaturen, da dann der Humboldt-Strom kalte antarktische Gewässer in die Region bringt.
Die beiden unterschiedlichen Jahreszeiten markieren gleichzeitig den Beginn und das Ende der Paarungszeit für den Großteil der diversen Spezien.
Darüber hinaus gibt es aber auch Monate, an denen sich beide Jahreszeiten überlappen. So herrscht jeweils zwischen April und Juni sowie zwischen November und Januar ein Mischklima.  ​